本文主要介绍在医学图像处理领域,常见的两种医学图像格式 .nii 和 DICOM 文件怎么查看。
一、.nii 文件的查看
主要介绍两种方式,一种是直接用软件打开,另一种是用python代码打开并查看,前者可以从各个视角进行查看,后者的灵活性更好。
1. ITK-SNAP 软件
ITK-SNAP 软件的下载地址为:下载地址
安装之后在打开 .nii 格式的文件时直接选择该软件即可,如上图所示,该软件可以显示在 x、y、z 三个轴方向上的视角,并且可以进行调整。如果不仅想要展示医学图像本身,还要展示对应的分割结果,则可以把分割结果的 .nii 文件直接拖入软件窗口中,并选择以分割的形式载入即可。但是据我目前的使用来说,好像不能同时载入多个分割结果(比如一个器官本身的分割,一个肿瘤部位的分割)。
2. Python 代码查看 .nii 文件
相关的代码见我的 github:地址
我给出了两个代码,一个是可以同时显示器官、器官分割结果、肿瘤分割结果的,另一个是只显示器官的。当然,大家可以在第一个的基础上做改动。与 ITK-SNAP 不同,在显示的时候只显示分割结果的边界,这样更有利于观察分割的是否合理。并且还可以通过调节上图中右边红框中的滑块来调节图像灰度值的范围,通过调节上图中下方红框中滑块来查看不同横截面的图像。
二、DICOM 文件的查看
查看 DICOM 格式图像的最简便的方式是使用软件,这里给大家推荐两个软件:MicroDicom 和 RadiAnt Viewer,前者是完全免费的,后者只能试用,后者的功能更强大,可以实现三维重建等。
1. MicroDicom 软件
MicroDicom 软件的下载地址:下载地址
一般同一个病人的一套 DICOM 图像存储在同一个文件夹中,直接在该文件夹上右键选择用 MicroDicom 打开即可,当然也可以查看某一张图像。
2. RadiAnt Viewer
RadiAnt Viewer 的下载地址:下载地址
由于我的 RadiAnt Viewer 到期了……所以就不做演示了。
- 本文作者: 俎志昂
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